İlgili YMM tarafından raporun dispozisyonu, içeriği ve eklerine ilişkin eksikliklerin veya tereddüt uyandıran hususların giderilmesi durumunda, iade raporunun işlemlerine vergi dairesince kaldığı yerden devam edilecektir. Vergi daireleri iade raporlarını işleme koymaktan imtina edemezler. Ancak, aşağıdaki hususların varlığı halinde, vergi dairelerince işlem yapılmaması ve iadenin gerçekleştirilmemesi esastır.
Karşıt inceleme tutanaklarının düzenlenmesi ve rapora ilave edilmek suretiyle vergi dairelerine bildirilmesi halinde, Yeminli Mali Müşavirlerin mesleki özeni yerine getirmiş olunmaktadır. Aksi takdirde, Yeminli Mali Müşavirlerin iade alan mükellefle birlikte müteselsilen sorumluluğu bahse konu olacaktır. Nitekim Yeminli Mali Müşavirlerin sorumluluğu kusursuz sorumluluk değildir. Yani mesleki özeni gösteren ve karşıt inceleme tutanaklarını eksiksiz yapan YMM hakkında müteselsil sorumluluk kapsamında takibat yapılamayacağı yönünde Danıştay 4. Dairesinin kararları vardır.
Yapılan yoklama işleminden sonra, tutanaklardaki bilgiler vergi dairesi müdürü tarafından incelenir. Mükellefin işletme kapasitesi ile iş hacmi arasında uyumsuzluk yoksa, vergi dairesi müdürü tarafından varsa YMM raporu işlemi konularak, iade işlemi gerçekleştirilir.
İhracatçıların günümüz koşullarında yasal mevzuat çerçevesinde yurt dışına mal sevkiyatının hayali olmasının mümkün olup olmayacağı, bu vesileyle iade edilen KDV tutarlarının yasal olup olmayacağı yazımız konusunu oluşturmaktadır.
Kurumlar vergisinden istisna kazançların kurumlar vergisi beyannamesi üzerinde gösterilerek kurum kazancından indirilebilmesi için YMM tasdik raporu ibrazı şartı mevcuttur.
Yeminli mali müşavirlerce tasdik edilecek yıllık gelir ya da kurumlar vergisi beyannamesi ile ilgili defter ve belgeler üzerinde yapılacak denetim, cari denetim şeklinde olacaktır.