İlgili YMM tarafından raporun dispozisyonu, içeriği ve eklerine ilişkin eksikliklerin veya tereddüt uyandıran hususların giderilmesi durumunda, iade raporunun işlemlerine vergi dairesince kaldığı yerden devam edilecektir. Vergi daireleri iade raporlarını işleme koymaktan imtina edemezler. Ancak, aşağıdaki hususların varlığı halinde, vergi dairelerince işlem yapılmaması ve iadenin gerçekleştirilmemesi esastır.
Karşıt inceleme tutanaklarının düzenlenmesi ve rapora ilave edilmek suretiyle vergi dairelerine bildirilmesi halinde, Yeminli Mali Müşavirlerin mesleki özeni yerine getirmiş olunmaktadır. Aksi takdirde, Yeminli Mali Müşavirlerin iade alan mükellefle birlikte müteselsilen sorumluluğu bahse konu olacaktır. Nitekim Yeminli Mali Müşavirlerin sorumluluğu kusursuz sorumluluk değildir. Yani mesleki özeni gösteren ve karşıt inceleme tutanaklarını eksiksiz yapan YMM hakkında müteselsil sorumluluk kapsamında takibat yapılamayacağı yönünde Danıştay 4. Dairesinin kararları vardır.
Yeminli mali müşavirler tarafından e-defter uygulamasına dahil olan mükelleflere yönelik olarak tanzim olunacak tasdik raporları ile bu mükelleflere mal ve hizmet sağlayan ve e-defter uygulaması kapsamında defter tutmakta olan alt mükellefler nezdinde tanzim olunacak karşıt inceleme tutanakları ve teyit-bilgi isteme cevap yazılarında; defter tasdik bilgisi ve iade ile ilişkili fatura vb. belgelerin defter kayıtları bültenimizde incelenmektedir.
213 sayılı Kanunun 3/B maddesine göre vergilendirmede vergiyi doğuran olay ve bu olaya
ilişkin muamelelerin gerçek mahiyeti esas olup, vergiyi doğuran olay ve bu olaya ilişkin muamelelerin
gerçek mahiyetinin yemin hariç her türlü delille ispatlanması mümkündür.